Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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