Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms