Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28510A0A087WP28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gm28510A0A087WP28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28510A0A087WP28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gm28510A0A087WP28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gm28510A0A087WP28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28510A0A087WP28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gm28510A0A087WP28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gm28510A0A087WP28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28510A0A087WP28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms