Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnurfQ9WU12 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnurfQ9WU12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnurfQ9WU12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnurfQ9WU12 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnurfQ9WU12 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnurfQ9WU12 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnurfQ9WU12 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnurfQ9WU12 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnurfQ9WU12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnurfQ9WU12 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnurfQ9WU12 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnurfQ9WU12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnurfQ9WU12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnurfQ9WU12 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnurfQ9WU12 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnurfQ9WU12 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SnurfQ9WU12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms