Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTI7

Myo1c, Unconventional myosin-Ic, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1cQ9WTI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Myo1cQ9WTI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Myo1cQ9WTI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Myo1cQ9WTI7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Myo1cQ9WTI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Myo1cQ9WTI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Myo1cQ9WTI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Myo1cQ9WTI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Myo1cQ9WTI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Myo1cQ9WTI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Myo1cQ9WTI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Myo1cQ9WTI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Myo1cQ9WTI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Myo1cQ9WTI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Myo1cQ9WTI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Myo1cQ9WTI7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Myo1cQ9WTI7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Myo1cQ9WTI7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Myo1cQ9WTI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Myo1cQ9WTI7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Myo1cQ9WTI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Myo1cQ9WTI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Myo1cQ9WTI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Myo1cQ9WTI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Myo1cQ9WTI7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Myo1cQ9WTI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Myo1cQ9WTI7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Myo1cQ9WTI7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Myo1cQ9WTI7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Myo1cQ9WTI7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Myo1cQ9WTI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Myo1cQ9WTI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Myo1cQ9WTI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Myo1cQ9WTI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Myo1cQ9WTI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Myo1cQ9WTI7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Myo1cQ9WTI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Myo1cQ9WTI7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Myo1cQ9WTI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Myo1cQ9WTI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Myo1cQ9WTI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Myo1cQ9WTI7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Myo1cQ9WTI7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Myo1cQ9WTI7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Myo1cQ9WTI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Myo1cQ9WTI7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Myo1cQ9WTI7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Myo1cQ9WTI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Myo1cQ9WTI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Myo1cQ9WTI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Myo1cQ9WTI7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Myo1cQ9WTI7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Myo1cQ9WTI7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Myo1cQ9WTI7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Myo1cQ9WTI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Myo1cQ9WTI7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Myo1cQ9WTI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Myo1cQ9WTI7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Myo1cQ9WTI7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Myo1cQ9WTI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Myo1cQ9WTI7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Myo1cQ9WTI7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Myo1cQ9WTI7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Myo1cQ9WTI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,3 ms