Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr9Q9EQU3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlr9Q9EQU3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tlr9Q9EQU3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlr9Q9EQU3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlr9Q9EQU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tlr9Q9EQU3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr9Q9EQU3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr9Q9EQU3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr9Q9EQU3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr9Q9EQU3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr9Q9EQU3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr9Q9EQU3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr9Q9EQU3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tlr9Q9EQU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr9Q9EQU3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tlr9Q9EQU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tlr9Q9EQU3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlr9Q9EQU3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlr9Q9EQU3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlr9Q9EQU3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlr9Q9EQU3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr9Q9EQU3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr9Q9EQU3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr9Q9EQU3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tlr9Q9EQU3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tlr9Q9EQU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlr9Q9EQU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlr9Q9EQU3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlr9Q9EQU3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr9Q9EQU3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlr9Q9EQU3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr9Q9EQU3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlr9Q9EQU3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tlr9Q9EQU3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlr9Q9EQU3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tlr9Q9EQU3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlr9Q9EQU3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tlr9Q9EQU3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tlr9Q9EQU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tlr9Q9EQU3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tlr9Q9EQU3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tlr9Q9EQU3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tlr9Q9EQU3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tlr9Q9EQU3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlr9Q9EQU3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlr9Q9EQU3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlr9Q9EQU3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tlr9Q9EQU3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tlr9Q9EQU3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr9Q9EQU3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tlr9Q9EQU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tlr9Q9EQU3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr9Q9EQU3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tlr9Q9EQU3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlr9Q9EQU3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlr9Q9EQU3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tlr9Q9EQU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tlr9Q9EQU3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr9Q9EQU3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr9Q9EQU3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr9Q9EQU3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tlr9Q9EQU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr9Q9EQU3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr9Q9EQU3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr9Q9EQU3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr9Q9EQU3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms