Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP96

Slco1a4, Solute carrier organic anion transporter family member 1A4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a4Q9EP96 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slco1a4Q9EP96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slco1a4Q9EP96 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slco1a4Q9EP96 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slco1a4Q9EP96 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco1a4Q9EP96 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slco1a4Q9EP96 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco1a4Q9EP96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco1a4Q9EP96 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco1a4Q9EP96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco1a4Q9EP96 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slco1a4Q9EP96 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slco1a4Q9EP96 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco1a4Q9EP96 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco1a4Q9EP96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slco1a4Q9EP96 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1a4Q9EP96 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco1a4Q9EP96 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slco1a4Q9EP96 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slco1a4Q9EP96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slco1a4Q9EP96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slco1a4Q9EP96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slco1a4Q9EP96 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slco1a4Q9EP96 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco1a4Q9EP96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slco1a4Q9EP96 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slco1a4Q9EP96 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slco1a4Q9EP96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slco1a4Q9EP96 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slco1a4Q9EP96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slco1a4Q9EP96 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco1a4Q9EP96 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1a4Q9EP96 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Slco1a4Q9EP96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slco1a4Q9EP96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slco1a4Q9EP96 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slco1a4Q9EP96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slco1a4Q9EP96 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slco1a4Q9EP96 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1a4Q9EP96 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slco1a4Q9EP96 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slco1a4Q9EP96 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slco1a4Q9EP96 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slco1a4Q9EP96 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slco1a4Q9EP96 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slco1a4Q9EP96 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slco1a4Q9EP96 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slco1a4Q9EP96 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slco1a4Q9EP96 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco1a4Q9EP96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms