Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf13cQ9D8D0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf13cQ9D8D0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf13cQ9D8D0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms