Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc130Q9D516 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc130Q9D516 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc130Q9D516 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc130Q9D516 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc130Q9D516 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc130Q9D516 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc130Q9D516 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc130Q9D516 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc130Q9D516 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc130Q9D516 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc130Q9D516 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc130Q9D516 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc130Q9D516 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc130Q9D516 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc130Q9D516 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc130Q9D516 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc130Q9D516 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc130Q9D516 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc130Q9D516 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc130Q9D516 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc130Q9D516 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc130Q9D516 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc130Q9D516 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc130Q9D516 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc130Q9D516 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc130Q9D516 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc130Q9D516 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc130Q9D516 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc130Q9D516 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc130Q9D516 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc130Q9D516 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc130Q9D516 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc130Q9D516 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc130Q9D516 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc130Q9D516 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc130Q9D516 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc130Q9D516 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc130Q9D516 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc130Q9D516 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc130Q9D516 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc130Q9D516 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc130Q9D516 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc130Q9D516 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc130Q9D516 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc130Q9D516 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc130Q9D516 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc130Q9D516 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc130Q9D516 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc130Q9D516 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc130Q9D516 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc130Q9D516 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc130Q9D516 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc130Q9D516 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc130Q9D516 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc130Q9D516 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc130Q9D516 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc130Q9D516 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc130Q9D516 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc130Q9D516 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc130Q9D516 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc130Q9D516 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc130Q9D516 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms