Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G7

Lce1l, Late cornified envelope 1L, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce1lQ9D1G7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lce1lQ9D1G7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lce1lQ9D1G7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lce1lQ9D1G7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lce1lQ9D1G7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lce1lQ9D1G7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lce1lQ9D1G7 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lce1lQ9D1G7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lce1lQ9D1G7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lce1lQ9D1G7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lce1lQ9D1G7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lce1lQ9D1G7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lce1lQ9D1G7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 994.5 ms