Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Mrpl55Q9CZ83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,4
Mrpl55Q9CZ83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17,51■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Mrpl55Q9CZ83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Mrpl55Q9CZ83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Mrpl55Q9CZ83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,3■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,29■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Mrpl55Q9CZ83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17,27■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17,25■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Mrpl55Q9CZ83 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17,2■□□□□ 0,34
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Mrpl55Q9CZ83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Mrpl55Q9CZ83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Mrpl55Q9CZ83 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,16■□□□□ 0,34
Mrpl55Q9CZ83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,13■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,09■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Mrpl55Q9CZ83 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17,05■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17,05■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Mrpl55Q9CZ83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17,01■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Mrpl55Q9CZ83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Mrpl55Q9CZ83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Mrpl55Q9CZ83 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms