Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931417E11RikQ9CR05 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931417E11RikQ9CR05 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931417E11RikQ9CR05 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4931417E11RikQ9CR05 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4931417E11RikQ9CR05 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4931417E11RikQ9CR05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4931417E11RikQ9CR05 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4931417E11RikQ9CR05 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4931417E11RikQ9CR05 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4931417E11RikQ9CR05 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931417E11RikQ9CR05 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4931417E11RikQ9CR05 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4931417E11RikQ9CR05 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4931417E11RikQ9CR05 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4931417E11RikQ9CR05 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4931417E11RikQ9CR05 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
4931417E11RikQ9CR05 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4931417E11RikQ9CR05 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4931417E11RikQ9CR05 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4931417E11RikQ9CR05 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4931417E11RikQ9CR05 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4931417E11RikQ9CR05 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931417E11RikQ9CR05 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931417E11RikQ9CR05 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4931417E11RikQ9CR05 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4931417E11RikQ9CR05 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4931417E11RikQ9CR05 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931417E11RikQ9CR05 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931417E11RikQ9CR05 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931417E11RikQ9CR05 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931417E11RikQ9CR05 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931417E11RikQ9CR05 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931417E11RikQ9CR05 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931417E11RikQ9CR05 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931417E11RikQ9CR05 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4931417E11RikQ9CR05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931417E11RikQ9CR05 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931417E11RikQ9CR05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931417E11RikQ9CR05 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931417E11RikQ9CR05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931417E11RikQ9CR05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931417E11RikQ9CR05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931417E11RikQ9CR05 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931417E11RikQ9CR05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931417E11RikQ9CR05 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4931417E11RikQ9CR05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
4931417E11RikQ9CR05 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931417E11RikQ9CR05 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4931417E11RikQ9CR05 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931417E11RikQ9CR05 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931417E11RikQ9CR05 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4931417E11RikQ9CR05 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4931417E11RikQ9CR05 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms