Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CQF4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9CQF4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CQF4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9CQF4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9CQF4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9CQF4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CQF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9CQF4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CQF4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9CQF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9CQF4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9CQF4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9CQF4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9CQF4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CQF4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9CQF4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CQF4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CQF4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CQF4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CQF4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQF4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CQF4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CQF4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CQF4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9CQF4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CQF4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CQF4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CQF4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CQF4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9CQF4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CQF4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CQF4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CQF4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9CQF4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CQF4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CQF4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CQF4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CQF4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CQF4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CQF4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CQF4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9CQF4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CQF4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CQF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CQF4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQF4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9CQF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQF4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CQF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CQF4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CQF4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CQF4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CQF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CQF4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CQF4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms