Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
4921530L21RikQ9CQ47 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4921530L21RikQ9CQ47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4921530L21RikQ9CQ47 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4921530L21RikQ9CQ47 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4921530L21RikQ9CQ47 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4921530L21RikQ9CQ47 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4921530L21RikQ9CQ47 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4921530L21RikQ9CQ47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4921530L21RikQ9CQ47 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4921530L21RikQ9CQ47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4921530L21RikQ9CQ47 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
4921530L21RikQ9CQ47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4921530L21RikQ9CQ47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4921530L21RikQ9CQ47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
4921530L21RikQ9CQ47 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4921530L21RikQ9CQ47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4921530L21RikQ9CQ47 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4921530L21RikQ9CQ47 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4921530L21RikQ9CQ47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4921530L21RikQ9CQ47 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4921530L21RikQ9CQ47 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4921530L21RikQ9CQ47 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4921530L21RikQ9CQ47 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4921530L21RikQ9CQ47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4921530L21RikQ9CQ47 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4921530L21RikQ9CQ47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4921530L21RikQ9CQ47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4921530L21RikQ9CQ47 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4921530L21RikQ9CQ47 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4921530L21RikQ9CQ47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4921530L21RikQ9CQ47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4921530L21RikQ9CQ47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4921530L21RikQ9CQ47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4921530L21RikQ9CQ47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4921530L21RikQ9CQ47 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4921530L21RikQ9CQ47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4921530L21RikQ9CQ47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4921530L21RikQ9CQ47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms