Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GatbQ99JT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GatbQ99JT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GatbQ99JT1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GatbQ99JT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GatbQ99JT1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GatbQ99JT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GatbQ99JT1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GatbQ99JT1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GatbQ99JT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GatbQ99JT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GatbQ99JT1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GatbQ99JT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GatbQ99JT1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GatbQ99JT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GatbQ99JT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GatbQ99JT1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GatbQ99JT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GatbQ99JT1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GatbQ99JT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GatbQ99JT1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GatbQ99JT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GatbQ99JT1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GatbQ99JT1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GatbQ99JT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GatbQ99JT1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GatbQ99JT1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GatbQ99JT1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GatbQ99JT1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GatbQ99JT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GatbQ99JT1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GatbQ99JT1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GatbQ99JT1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GatbQ99JT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GatbQ99JT1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GatbQ99JT1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GatbQ99JT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GatbQ99JT1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GatbQ99JT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GatbQ99JT1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GatbQ99JT1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GatbQ99JT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GatbQ99JT1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GatbQ99JT1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GatbQ99JT1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GatbQ99JT1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GatbQ99JT1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GatbQ99JT1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GatbQ99JT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GatbQ99JT1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GatbQ99JT1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GatbQ99JT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GatbQ99JT1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GatbQ99JT1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GatbQ99JT1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms