Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptssbQ925E8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptssbQ925E8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SptssbQ925E8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptssbQ925E8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptssbQ925E8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SptssbQ925E8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptssbQ925E8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SptssbQ925E8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SptssbQ925E8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptssbQ925E8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptssbQ925E8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptssbQ925E8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptssbQ925E8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptssbQ925E8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SptssbQ925E8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SptssbQ925E8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptssbQ925E8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptssbQ925E8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptssbQ925E8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SptssbQ925E8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SptssbQ925E8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SptssbQ925E8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms