Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BbxQ8VBW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BbxQ8VBW5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BbxQ8VBW5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BbxQ8VBW5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BbxQ8VBW5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BbxQ8VBW5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BbxQ8VBW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BbxQ8VBW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BbxQ8VBW5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BbxQ8VBW5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BbxQ8VBW5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BbxQ8VBW5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BbxQ8VBW5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BbxQ8VBW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BbxQ8VBW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BbxQ8VBW5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BbxQ8VBW5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BbxQ8VBW5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BbxQ8VBW5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BbxQ8VBW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BbxQ8VBW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BbxQ8VBW5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BbxQ8VBW5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BbxQ8VBW5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BbxQ8VBW5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BbxQ8VBW5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BbxQ8VBW5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BbxQ8VBW5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BbxQ8VBW5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BbxQ8VBW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BbxQ8VBW5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BbxQ8VBW5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BbxQ8VBW5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BbxQ8VBW5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BbxQ8VBW5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BbxQ8VBW5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BbxQ8VBW5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BbxQ8VBW5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BbxQ8VBW5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BbxQ8VBW5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BbxQ8VBW5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BbxQ8VBW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BbxQ8VBW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BbxQ8VBW5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BbxQ8VBW5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BbxQ8VBW5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BbxQ8VBW5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BbxQ8VBW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BbxQ8VBW5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BbxQ8VBW5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BbxQ8VBW5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BbxQ8VBW5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BbxQ8VBW5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BbxQ8VBW5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BbxQ8VBW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BbxQ8VBW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BbxQ8VBW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BbxQ8VBW5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BbxQ8VBW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BbxQ8VBW5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BbxQ8VBW5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BbxQ8VBW5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BbxQ8VBW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BbxQ8VBW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BbxQ8VBW5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BbxQ8VBW5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms