Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl42Q8BFQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl42Q8BFQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl42Q8BFQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl42Q8BFQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl42Q8BFQ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl42Q8BFQ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl42Q8BFQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl42Q8BFQ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl42Q8BFQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl42Q8BFQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl42Q8BFQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl42Q8BFQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl42Q8BFQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl42Q8BFQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl42Q8BFQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl42Q8BFQ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl42Q8BFQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl42Q8BFQ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl42Q8BFQ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl42Q8BFQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl42Q8BFQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl42Q8BFQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl42Q8BFQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl42Q8BFQ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl42Q8BFQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl42Q8BFQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl42Q8BFQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl42Q8BFQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl42Q8BFQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl42Q8BFQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl42Q8BFQ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl42Q8BFQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl42Q8BFQ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl42Q8BFQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl42Q8BFQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl42Q8BFQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl42Q8BFQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl42Q8BFQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klhl42Q8BFQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl42Q8BFQ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl42Q8BFQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl42Q8BFQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl42Q8BFQ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl42Q8BFQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl42Q8BFQ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl42Q8BFQ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms