Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clec4b2Q67DU8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clec4b2Q67DU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clec4b2Q67DU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clec4b2Q67DU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clec4b2Q67DU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clec4b2Q67DU8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clec4b2Q67DU8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clec4b2Q67DU8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clec4b2Q67DU8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clec4b2Q67DU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clec4b2Q67DU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clec4b2Q67DU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clec4b2Q67DU8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clec4b2Q67DU8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clec4b2Q67DU8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clec4b2Q67DU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clec4b2Q67DU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec4b2Q67DU8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec4b2Q67DU8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec4b2Q67DU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec4b2Q67DU8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec4b2Q67DU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec4b2Q67DU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec4b2Q67DU8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clec4b2Q67DU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clec4b2Q67DU8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clec4b2Q67DU8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clec4b2Q67DU8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clec4b2Q67DU8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec4b2Q67DU8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec4b2Q67DU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec4b2Q67DU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec4b2Q67DU8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec4b2Q67DU8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec4b2Q67DU8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec4b2Q67DU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec4b2Q67DU8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec4b2Q67DU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec4b2Q67DU8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec4b2Q67DU8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec4b2Q67DU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms