Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Defa17Q64016 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Defa17Q64016 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Defa17Q64016 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Defa17Q64016 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Defa17Q64016 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Defa17Q64016 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Defa17Q64016 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Defa17Q64016 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Defa17Q64016 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Defa17Q64016 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Defa17Q64016 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Defa17Q64016 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Defa17Q64016 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Defa17Q64016 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Defa17Q64016 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Defa17Q64016 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Defa17Q64016 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Defa17Q64016 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Defa17Q64016 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Defa17Q64016 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Defa17Q64016 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Defa17Q64016 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Defa17Q64016 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Defa17Q64016 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Defa17Q64016 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Defa17Q64016 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Defa17Q64016 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Defa17Q64016 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Defa17Q64016 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Defa17Q64016 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Defa17Q64016 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Defa17Q64016 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Defa17Q64016 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Defa17Q64016 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Defa17Q64016 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Defa17Q64016 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Defa17Q64016 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Defa17Q64016 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Defa17Q64016 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Defa17Q64016 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Defa17Q64016 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Defa17Q64016 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Defa17Q64016 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Defa17Q64016 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Defa17Q64016 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Defa17Q64016 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Defa17Q64016 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Defa17Q64016 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Defa17Q64016 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Defa17Q64016 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Defa17Q64016 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Defa17Q64016 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Defa17Q64016 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Defa17Q64016 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Defa17Q64016 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa17Q64016 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Defa17Q64016 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Defa17Q64016 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Defa17Q64016 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Defa17Q64016 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Defa17Q64016 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Defa17Q64016 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Defa17Q64016 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Defa17Q64016 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa17Q64016 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Defa17Q64016 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Defa17Q64016 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Defa17Q64016 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Defa17Q64016 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Defa17Q64016 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Defa17Q64016 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,3 ms