Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup62Q63850 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup62Q63850 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup62Q63850 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup62Q63850 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup62Q63850 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup62Q63850 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup62Q63850 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup62Q63850 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup62Q63850 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup62Q63850 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup62Q63850 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup62Q63850 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup62Q63850 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup62Q63850 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup62Q63850 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup62Q63850 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup62Q63850 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup62Q63850 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup62Q63850 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup62Q63850 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup62Q63850 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup62Q63850 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup62Q63850 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup62Q63850 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup62Q63850 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup62Q63850 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup62Q63850 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup62Q63850 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nup62Q63850 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup62Q63850 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup62Q63850 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup62Q63850 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup62Q63850 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup62Q63850 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms