Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prm3Q62100 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prm3Q62100 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prm3Q62100 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prm3Q62100 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prm3Q62100 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prm3Q62100 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prm3Q62100 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prm3Q62100 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prm3Q62100 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prm3Q62100 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prm3Q62100 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prm3Q62100 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prm3Q62100 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prm3Q62100 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prm3Q62100 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prm3Q62100 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prm3Q62100 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prm3Q62100 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prm3Q62100 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prm3Q62100 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prm3Q62100 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prm3Q62100 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prm3Q62100 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prm3Q62100 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prm3Q62100 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prm3Q62100 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prm3Q62100 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prm3Q62100 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prm3Q62100 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prm3Q62100 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prm3Q62100 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prm3Q62100 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prm3Q62100 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prm3Q62100 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prm3Q62100 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prm3Q62100 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prm3Q62100 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prm3Q62100 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prm3Q62100 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prm3Q62100 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms