Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IbspQ61711 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IbspQ61711 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IbspQ61711 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IbspQ61711 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IbspQ61711 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IbspQ61711 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IbspQ61711 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IbspQ61711 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IbspQ61711 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IbspQ61711 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IbspQ61711 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IbspQ61711 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IbspQ61711 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IbspQ61711 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IbspQ61711 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IbspQ61711 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IbspQ61711 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IbspQ61711 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IbspQ61711 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IbspQ61711 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IbspQ61711 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IbspQ61711 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IbspQ61711 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IbspQ61711 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IbspQ61711 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IbspQ61711 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
IbspQ61711 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IbspQ61711 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IbspQ61711 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IbspQ61711 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IbspQ61711 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IbspQ61711 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IbspQ61711 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IbspQ61711 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IbspQ61711 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IbspQ61711 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IbspQ61711 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IbspQ61711 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IbspQ61711 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IbspQ61711 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IbspQ61711 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IbspQ61711 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IbspQ61711 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IbspQ61711 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IbspQ61711 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IbspQ61711 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IbspQ61711 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IbspQ61711 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IbspQ61711 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IbspQ61711 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms