Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DbpQ60925 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DbpQ60925 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DbpQ60925 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DbpQ60925 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DbpQ60925 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DbpQ60925 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DbpQ60925 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DbpQ60925 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DbpQ60925 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DbpQ60925 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DbpQ60925 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DbpQ60925 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DbpQ60925 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DbpQ60925 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DbpQ60925 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DbpQ60925 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DbpQ60925 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DbpQ60925 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DbpQ60925 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DbpQ60925 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DbpQ60925 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DbpQ60925 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DbpQ60925 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DbpQ60925 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DbpQ60925 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DbpQ60925 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DbpQ60925 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DbpQ60925 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DbpQ60925 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DbpQ60925 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DbpQ60925 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DbpQ60925 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DbpQ60925 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DbpQ60925 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DbpQ60925 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DbpQ60925 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DbpQ60925 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DbpQ60925 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DbpQ60925 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbpQ60925 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DbpQ60925 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DbpQ60925 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbpQ60925 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbpQ60925 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DbpQ60925 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DbpQ60925 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DbpQ60925 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbpQ60925 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DbpQ60925 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DbpQ60925 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DbpQ60925 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DbpQ60925 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DbpQ60925 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms