Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm2aQ60648 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2aQ60648 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm2aQ60648 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm2aQ60648 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2aQ60648 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm2aQ60648 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm2aQ60648 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2aQ60648 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2aQ60648 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2aQ60648 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm2aQ60648 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2aQ60648 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2aQ60648 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm2aQ60648 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2aQ60648 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm2aQ60648 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm2aQ60648 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm2aQ60648 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2aQ60648 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2aQ60648 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2aQ60648 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2aQ60648 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2aQ60648 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2aQ60648 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2aQ60648 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm2aQ60648 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm2aQ60648 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2aQ60648 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2aQ60648 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm2aQ60648 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2aQ60648 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2aQ60648 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2aQ60648 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2aQ60648 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm2aQ60648 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2aQ60648 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2aQ60648 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2aQ60648 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2aQ60648 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2aQ60648 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2aQ60648 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm2aQ60648 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms