Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mks1Q5SW45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mks1Q5SW45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mks1Q5SW45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mks1Q5SW45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mks1Q5SW45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mks1Q5SW45 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mks1Q5SW45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mks1Q5SW45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mks1Q5SW45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mks1Q5SW45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mks1Q5SW45 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mks1Q5SW45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mks1Q5SW45 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mks1Q5SW45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mks1Q5SW45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mks1Q5SW45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mks1Q5SW45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mks1Q5SW45 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mks1Q5SW45 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mks1Q5SW45 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mks1Q5SW45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Mks1Q5SW45 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mks1Q5SW45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mks1Q5SW45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mks1Q5SW45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mks1Q5SW45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mks1Q5SW45 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mks1Q5SW45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mks1Q5SW45 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mks1Q5SW45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mks1Q5SW45 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mks1Q5SW45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mks1Q5SW45 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mks1Q5SW45 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mks1Q5SW45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mks1Q5SW45 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mks1Q5SW45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mks1Q5SW45 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mks1Q5SW45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mks1Q5SW45 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mks1Q5SW45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mks1Q5SW45 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mks1Q5SW45 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mks1Q5SW45 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mks1Q5SW45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mks1Q5SW45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mks1Q5SW45 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mks1Q5SW45 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mks1Q5SW45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mks1Q5SW45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mks1Q5SW45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mks1Q5SW45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mks1Q5SW45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms