Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r7Q3UM45 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppp1r7Q3UM45 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r7Q3UM45 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r7Q3UM45 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r7Q3UM45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r7Q3UM45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r7Q3UM45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp1r7Q3UM45 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp1r7Q3UM45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r7Q3UM45 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r7Q3UM45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r7Q3UM45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r7Q3UM45 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp1r7Q3UM45 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r7Q3UM45 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r7Q3UM45 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r7Q3UM45 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r7Q3UM45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r7Q3UM45 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r7Q3UM45 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r7Q3UM45 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r7Q3UM45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r7Q3UM45 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r7Q3UM45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r7Q3UM45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r7Q3UM45 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r7Q3UM45 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r7Q3UM45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r7Q3UM45 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r7Q3UM45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r7Q3UM45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppp1r7Q3UM45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r7Q3UM45 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r7Q3UM45 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r7Q3UM45 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r7Q3UM45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r7Q3UM45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp1r7Q3UM45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r7Q3UM45 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r7Q3UM45 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r7Q3UM45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r7Q3UM45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r7Q3UM45 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r7Q3UM45 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r7Q3UM45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r7Q3UM45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r7Q3UM45 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r7Q3UM45 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r7Q3UM45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r7Q3UM45 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r7Q3UM45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r7Q3UM45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r7Q3UM45 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r7Q3UM45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r7Q3UM45 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r7Q3UM45 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r7Q3UM45 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r7Q3UM45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r7Q3UM45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r7Q3UM45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r7Q3UM45 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r7Q3UM45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r7Q3UM45 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r7Q3UM45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r7Q3UM45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r7Q3UM45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r7Q3UM45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp1r7Q3UM45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r7Q3UM45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms