Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtel1Q0VGM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtel1Q0VGM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtel1Q0VGM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtel1Q0VGM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtel1Q0VGM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtel1Q0VGM9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtel1Q0VGM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtel1Q0VGM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtel1Q0VGM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtel1Q0VGM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtel1Q0VGM9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtel1Q0VGM9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtel1Q0VGM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtel1Q0VGM9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rtel1Q0VGM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtel1Q0VGM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtel1Q0VGM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtel1Q0VGM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtel1Q0VGM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtel1Q0VGM9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtel1Q0VGM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtel1Q0VGM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtel1Q0VGM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtel1Q0VGM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtel1Q0VGM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtel1Q0VGM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtel1Q0VGM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtel1Q0VGM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtel1Q0VGM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtel1Q0VGM9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtel1Q0VGM9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtel1Q0VGM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtel1Q0VGM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rtel1Q0VGM9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rtel1Q0VGM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtel1Q0VGM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtel1Q0VGM9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtel1Q0VGM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtel1Q0VGM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtel1Q0VGM9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtel1Q0VGM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtel1Q0VGM9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtel1Q0VGM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtel1Q0VGM9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtel1Q0VGM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtel1Q0VGM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtel1Q0VGM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtel1Q0VGM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtel1Q0VGM9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtel1Q0VGM9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtel1Q0VGM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtel1Q0VGM9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtel1Q0VGM9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtel1Q0VGM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtel1Q0VGM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtel1Q0VGM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Rtel1Q0VGM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtel1Q0VGM9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.2 ms