Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtgirP43252 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgirP43252 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtgirP43252 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtgirP43252 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtgirP43252 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgirP43252 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgirP43252 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtgirP43252 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtgirP43252 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgirP43252 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtgirP43252 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtgirP43252 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtgirP43252 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtgirP43252 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtgirP43252 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgirP43252 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgirP43252 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgirP43252 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgirP43252 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgirP43252 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgirP43252 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgirP43252 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgirP43252 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgirP43252 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgirP43252 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgirP43252 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgirP43252 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgirP43252 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgirP43252 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtgirP43252 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgirP43252 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtgirP43252 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgirP43252 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgirP43252 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgirP43252 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgirP43252 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgirP43252 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgirP43252 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgirP43252 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtgirP43252 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgirP43252 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgirP43252 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtgirP43252 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtgirP43252 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtgirP43252 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtgirP43252 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtgirP43252 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtgirP43252 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgirP43252 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgirP43252 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgirP43252 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgirP43252 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgirP43252 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms