Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PomcP01193 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PomcP01193 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PomcP01193 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PomcP01193 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PomcP01193 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PomcP01193 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PomcP01193 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PomcP01193 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PomcP01193 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PomcP01193 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PomcP01193 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PomcP01193 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PomcP01193 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PomcP01193 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PomcP01193 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PomcP01193 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PomcP01193 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PomcP01193 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PomcP01193 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PomcP01193 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PomcP01193 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PomcP01193 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PomcP01193 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PomcP01193 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PomcP01193 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PomcP01193 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PomcP01193 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PomcP01193 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PomcP01193 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PomcP01193 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PomcP01193 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PomcP01193 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PomcP01193 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PomcP01193 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PomcP01193 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PomcP01193 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PomcP01193 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PomcP01193 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PomcP01193 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PomcP01193 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PomcP01193 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PomcP01193 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PomcP01193 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PomcP01193 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PomcP01193 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PomcP01193 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PomcP01193 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PomcP01193 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PomcP01193 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PomcP01193 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PomcP01193 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PomcP01193 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PomcP01193 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PomcP01193 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PomcP01193 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PomcP01193 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PomcP01193 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PomcP01193 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PomcP01193 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PomcP01193 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PomcP01193 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PomcP01193 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PomcP01193 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PomcP01193 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomcP01193 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomcP01193 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomcP01193 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomcP01193 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomcP01193 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomcP01193 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomcP01193 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomcP01193 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomcP01193 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PomcP01193 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomcP01193 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomcP01193 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PomcP01193 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PomcP01193 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomcP01193 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PomcP01193 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PomcP01193 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PomcP01193 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PomcP01193 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PomcP01193 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PomcP01193 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PomcP01193 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PomcP01193 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PomcP01193 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PomcP01193 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PomcP01193 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PomcP01193 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PomcP01193 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PomcP01193 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PomcP01193 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PomcP01193 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PomcP01193 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PomcP01193 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PomcP01193 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PomcP01193 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms