Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp2a2O55143 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp2a2O55143 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp2a2O55143 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2a2O55143 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp2a2O55143 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Atp2a2O55143 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2a2O55143 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2a2O55143 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp2a2O55143 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp2a2O55143 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp2a2O55143 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp2a2O55143 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp2a2O55143 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp2a2O55143 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp2a2O55143 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2a2O55143 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp2a2O55143 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp2a2O55143 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp2a2O55143 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2a2O55143 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2a2O55143 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2a2O55143 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2a2O55143 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2a2O55143 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2a2O55143 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2a2O55143 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2a2O55143 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp2a2O55143 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2a2O55143 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2a2O55143 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2a2O55143 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp2a2O55143 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp2a2O55143 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp2a2O55143 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp2a2O55143 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp2a2O55143 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp2a2O55143 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp2a2O55143 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp2a2O55143 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp2a2O55143 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp2a2O55143 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp2a2O55143 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp2a2O55143 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2a2O55143 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2a2O55143 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2a2O55143 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2a2O55143 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2a2O55143 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2a2O55143 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2a2O55143 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2a2O55143 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2a2O55143 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2a2O55143 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2a2O55143 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2a2O55143 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2a2O55143 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2a2O55143 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2a2O55143 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2a2O55143 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2a2O55143 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2a2O55143 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2a2O55143 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atp2a2O55143 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2a2O55143 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2a2O55143 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2a2O55143 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2a2O55143 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2a2O55143 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2a2O55143 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2a2O55143 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2a2O55143 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2a2O55143 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2a2O55143 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2a2O55143 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2a2O55143 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2a2O55143 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms