Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ArxO35085 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ArxO35085 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ArxO35085 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ArxO35085 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ArxO35085 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ArxO35085 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ArxO35085 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ArxO35085 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ArxO35085 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ArxO35085 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ArxO35085 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ArxO35085 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ArxO35085 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ArxO35085 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ArxO35085 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ArxO35085 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ArxO35085 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ArxO35085 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ArxO35085 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ArxO35085 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ArxO35085 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ArxO35085 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ArxO35085 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ArxO35085 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ArxO35085 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ArxO35085 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ArxO35085 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ArxO35085 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ArxO35085 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ArxO35085 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ArxO35085 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ArxO35085 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ArxO35085 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ArxO35085 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ArxO35085 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ArxO35085 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ArxO35085 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ArxO35085 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ArxO35085 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ArxO35085 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ArxO35085 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ArxO35085 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ArxO35085 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ArxO35085 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ArxO35085 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ArxO35085 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ArxO35085 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ArxO35085 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ArxO35085 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ArxO35085 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ArxO35085 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ArxO35085 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ArxO35085 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ArxO35085 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ArxO35085 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ArxO35085 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ArxO35085 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ArxO35085 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ArxO35085 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ArxO35085 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ArxO35085 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ArxO35085 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ArxO35085 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ArxO35085 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ArxO35085 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ArxO35085 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ArxO35085 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ArxO35085 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ArxO35085 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ArxO35085 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ArxO35085 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ArxO35085 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ArxO35085 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ArxO35085 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ArxO35085 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ArxO35085 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ArxO35085 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ArxO35085 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ArxO35085 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ArxO35085 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ArxO35085 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ArxO35085 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ArxO35085 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ArxO35085 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ArxO35085 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ArxO35085 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ArxO35085 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ArxO35085 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ArxO35085 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ArxO35085 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ArxO35085 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ArxO35085 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ArxO35085 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ArxO35085 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ArxO35085 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ArxO35085 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ArxO35085 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ArxO35085 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ArxO35085 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms