Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
PrkcshO08795 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
PrkcshO08795 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
PrkcshO08795 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
PrkcshO08795 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
PrkcshO08795 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
PrkcshO08795 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
PrkcshO08795 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
PrkcshO08795 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
PrkcshO08795 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
PrkcshO08795 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
PrkcshO08795 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
PrkcshO08795 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
PrkcshO08795 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
PrkcshO08795 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
PrkcshO08795 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
PrkcshO08795 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
PrkcshO08795 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
PrkcshO08795 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
PrkcshO08795 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31,85■■■□□ 2,69
PrkcshO08795 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
PrkcshO08795 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
PrkcshO08795 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
PrkcshO08795 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
PrkcshO08795 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
PrkcshO08795 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31,63■■■□□ 2,65
PrkcshO08795 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
PrkcshO08795 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
PrkcshO08795 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
PrkcshO08795 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
PrkcshO08795 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
PrkcshO08795 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
PrkcshO08795 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
PrkcshO08795 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
PrkcshO08795 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
PrkcshO08795 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
PrkcshO08795 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
PrkcshO08795 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
PrkcshO08795 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
PrkcshO08795 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,23■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
PrkcshO08795 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
PrkcshO08795 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
PrkcshO08795 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
PrkcshO08795 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
PrkcshO08795 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
PrkcshO08795 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
PrkcshO08795 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
PrkcshO08795 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
PrkcshO08795 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
PrkcshO08795 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
PrkcshO08795 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
PrkcshO08795 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
PrkcshO08795 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
PrkcshO08795 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
PrkcshO08795 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
PrkcshO08795 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
PrkcshO08795 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
PrkcshO08795 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
PrkcshO08795 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,78■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,52
PrkcshO08795 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
PrkcshO08795 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
PrkcshO08795 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
PrkcshO08795 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
PrkcshO08795 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
PrkcshO08795 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms