Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21972J3QN38 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21972J3QN38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21972J3QN38 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21972J3QN38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21972J3QN38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21972J3QN38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21972J3QN38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21972J3QN38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21972J3QN38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21972J3QN38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21972J3QN38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21972J3QN38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21972J3QN38 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21972J3QN38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21972J3QN38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21972J3QN38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21972J3QN38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21972J3QN38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21972J3QN38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21972J3QN38 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21972J3QN38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21972J3QN38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21972J3QN38 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21972J3QN38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21972J3QN38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21972J3QN38 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21972J3QN38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21972J3QN38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21972J3QN38 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21972J3QN38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21972J3QN38 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm21972J3QN38 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21972J3QN38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21972J3QN38 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21972J3QN38 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21972J3QN38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms