Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa27F2Z403 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa27F2Z403 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa27F2Z403 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa27F2Z403 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa27F2Z403 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa27F2Z403 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa27F2Z403 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa27F2Z403 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa27F2Z403 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa27F2Z403 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa27F2Z403 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa27F2Z403 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa27F2Z403 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa27F2Z403 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa27F2Z403 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa27F2Z403 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa27F2Z403 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa27F2Z403 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa27F2Z403 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa27F2Z403 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa27F2Z403 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa27F2Z403 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa27F2Z403 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa27F2Z403 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms