Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfta2E9PXB6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfta2E9PXB6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfta2E9PXB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfta2E9PXB6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfta2E9PXB6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfta2E9PXB6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfta2E9PXB6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfta2E9PXB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfta2E9PXB6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfta2E9PXB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfta2E9PXB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfta2E9PXB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfta2E9PXB6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfta2E9PXB6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfta2E9PXB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfta2E9PXB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfta2E9PXB6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfta2E9PXB6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfta2E9PXB6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfta2E9PXB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfta2E9PXB6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfta2E9PXB6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfta2E9PXB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfta2E9PXB6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfta2E9PXB6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfta2E9PXB6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfta2E9PXB6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfta2E9PXB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfta2E9PXB6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms