Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa28D3Z1V9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa28D3Z1V9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa28D3Z1V9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa28D3Z1V9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa28D3Z1V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa28D3Z1V9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa28D3Z1V9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa28D3Z1V9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa28D3Z1V9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa28D3Z1V9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa28D3Z1V9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa28D3Z1V9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa28D3Z1V9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa28D3Z1V9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa28D3Z1V9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa28D3Z1V9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa28D3Z1V9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa28D3Z1V9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa28D3Z1V9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa28D3Z1V9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa28D3Z1V9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa28D3Z1V9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa28D3Z1V9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa28D3Z1V9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa28D3Z1V9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa28D3Z1V9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa28D3Z1V9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa28D3Z1V9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa28D3Z1V9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa28D3Z1V9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms