Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms