Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D17h6s53eQ9Z1R4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms