Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms