Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nfe2l3Q9WTM4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nfe2l3Q9WTM4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nfe2l3Q9WTM4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nfe2l3Q9WTM4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms