Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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