Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms