Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Limd1Q9QXD8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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