Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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