Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
OtofQ9ESF1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms