Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Syde1Q9DBZ9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms