Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms