Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ift43Q9DA69 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ift43Q9DA69 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ift43Q9DA69 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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