Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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